За годы существования Институт принимал активное участие в программах целевых расходов Президиума РАН, программах фундаментальных исследований ОМН РАН, в проектах РФФИ, Минобрнауки РФ, ФЦП, а также в выполнении федеральных и региональных целевых программ научных исследований.
Программы фундаментальных научных исследований Отделения математических наук (ОМН) РАН
Федеральные и региональных целевых программ научных исследований
Проекты Российского Фонда фундаментальных исследований
Институт провел 28 международных симпозиумов и конференций, 19 школ молодых ученых и молодежных конференций, в которых приняли участие ведущие ученые и молодые исследователи из России, Абхазии, Азербайджана, Армении, Беларуси, Болгарии, Великобритании, Германии, Казахстана, Китая, Литвы, США, Таджикистана, Танзании, Узбекистана, Украины.